该漫画中的历史事件发生在《刺客信条IV：黑旗》之后。现代线以美韩混血儿诺亚·金为主角，讲述了他在中国澳门被阿布斯泰戈工业公司绑架后的故事；古代线剧情聚焦于1725年爱德华·肯威于东南亚地区寻找伊甸碎片的行动。